O consumo exagerado de leite de soja pode ser prejudicial à saúde porque ele pode dificultar a absorção de minerais e aminoácidos, e contém fitoestrogênios que podem alterar o funcionamento da tireoide. No entanto, estes malefícios podem ser minimizados se o consumo do leite de soja não for exagerado, pois o leite de soja pode trazer benefícios à saúde por conter menos calorias se comparado ao leite de vaca e uma boa quantidade de proteína magra e pouca quantidade de colesterol, sendo útil nas dietas para emagrecer, por exemplo.