O pus na garganta é causado devido a uma reação do corpo a infecções por vírus ou bactérias que inflamam as amígdalas e a faringe, causando doenças como mononucleose ou amigdalite bacteriana, por exemplo. O tratamento da infecção deve ser feito com uso de anti-inflamatórios, como ibuprofeno ou nimesulida, e, se necessário, antibióticos, como amoxicilina ou benzetacil, prescritos pelo clínico geral ou otorrino, para desinflamar e retirar o pus.