Geralmente, o tratamento para vaginose bacteriana é feito com antibióticos que podem ser administrados via oral ou aplicados diretamente na vagina. Além disso, existem também remédios caseiros que podem ajudar a aliviar os sintomas e medidas de prevenção para evitar uma recidiva. Os remédios mais utilizados no tratamento da vaginose bacteriana são: Metronidazol em comprimidos ou em creme vaginal, cuja dose recomendada é de 2g numa toma única ou 400 a 500 mg, 2 vezes ao dia, durante 7 dias, no caso dos comprimidos, e durante cerca de 10 a 20 dias, à noite, no caso do creme vaginal; Clindamicina em comprimidos ou creme vaginal, cuja dose recomendada varia entre 600 e 1800 mg, divididas em doses iguais ao longo do dia, durante um intervalo de tempo determinado pelo médico.