A endometriose ovariana, também chamada de endometrioma, se deve a presença de tecido endometrial, glândulas endometriais ou estroma, tecidos que só deveriam estar dentro do útero, recobrindo também o ovário. O médico pode descobrir que a mulher tem endometriose no ovário através da ultrassonografia transvaginal, que detecta principalmente um cisto no ovário com mais de 2 cm, cheio de líquido escuro.